Hạch toán hóa đơn thay thế là nghiệp vụ quan trọng khi doanh nghiệp cần điều chỉnh những sai sót trên hóa đơn đã phát hành. Nếu xử lý không đúng, số liệu kế toán có thể bị sai lệch và ảnh hưởng đến nghĩa vụ thuế. Việc nắm rõ cách hạch toán chuẩn sẽ giúp doanh nghiệp tránh rủi ro, đồng thời đảm bảo tính minh bạch trong quản lý tài chính. Bài viết này của AZTAX sẽ mang đến cho bạn kiến thức cần thiết để áp dụng hiệu quả.
1. Cách hạch toán hóa đơn thay thế chính xác nhất năm 2026
Dưới đây là cách hạch toán hóa đơn thay thế theo nguyên tắc hủy bút toán cũ và ghi nhận lại bút toán mới, áp dụng cho các trường hợp hóa đơn gốc đã được hạch toán.
Bài toán tổng hợp áp dụng cho tất cả những trường hợp:
| Hủy bút toán cũ |
|
| Lập bút toán mới |
|
Dưới đây là một số tình huống minh họa trong việc ghi nhận kế toán khi sử dụng hóa đơn thay thế:
- Trường hợp lập hóa đơn thay thế cho hóa đơn đã hủy.
- Trường hợp xử lý khi hóa đơn gốc bị thất lạc bằng cách phát hành hóa đơn thay thế.
- Trường hợp xuất hóa đơn thay thế do phát hiện sai sót trong hóa đơn ban đầu.
- Trường hợp điều chỉnh doanh thu, giá bán bằng hóa đơn thay thế.
- Trường hợp thay đổi thông tin của khách hàng và cần phát hành hóa đơn thay thế.
1.1. Hạch toán hóa đơn thay thế khi hóa đơn gốc bị hủy
Doanh nghiệp B trong quá trình bán hàng phát hiện hóa đơn ban đầu lập sai, với giá trị hàng hóa 60 triệu đồng (chưa tính 10% thuế GTGT). Sau đó, hóa đơn gốc bị hủy và doanh nghiệp tiến hành phát hành hóa đơn thay thế có thông tin chính xác.
Bút toán ghi nhận ban đầu:
- Nợ TK 131: 66.000.000 đồng
- Có TK 511: 60.000.000 đồng
- Có TK 3331: 6.000.000 đồng
Bút toán hủy hóa đơn gốc:
- Nợ TK 511: 60.000.000 đồng
- Nợ TK 3331: 6.000.000 đồng
- Có TK 131: 66.000.000 đồng
Bút toán lập lại theo hóa đơn thay thế:
- Nợ TK 131: 66.000.000 đồng
- Có TK 511: 60.000.000 đồng
- Có TK 3331: 6.000.000 đồng
1.2. Hạch toán hóa đơn thay thế trong trường hợp hóa đơn bị mất
Doanh nghiệp C đã lập và xuất hóa đơn cho khách hàng A với giá trị hàng hóa 200 triệu đồng (chưa bao gồm thuế GTGT 10%). Tuy nhiên, hóa đơn gốc bị thất lạc nên cần phải lập hóa đơn thay thế.
Bút toán ban đầu:
- Nợ TK 131: 220.000.000 đồng
- Có TK 511: 200.000.000 đồng
- Có TK 3331: 20.000.000 đồng
Xử lý khi phát hành hóa đơn thay thế:
- Nếu bút toán ban đầu đã được ghi nhận đầy đủ và chính xác thì không cần phải thực hiện hạch toán điều chỉnh.
- Trường hợp hóa đơn gốc chưa được hạch toán hoặc là có sai sót trong quá trình ghi nhận, kế toán cần căn cứ vào hóa đơn thay thế để ghi nhận lại đúng số liệu.
1.3. Hạch toán hóa đơn thay thế do sai sót
Doanh nghiệp D trong quá trình bán hàng đã lập hóa đơn cho khách trị giá 400 triệu đồng (chưa tính thuế GTGT 10%). Tuy nhiên, sau đó đã phát hiện sai sót về đơn giá, nên cần lập hóa đơn thay thế để điều chỉnh.
Bút toán ghi nhận ban đầu:
- Nợ TK 131:440.000.000 đồng
- Có TK 511: 400.000.000 đồng
- Có TK 3331: 40.000.000 đồng
Bút toán hủy bỏ hóa đơn gốc:
- Nợ TK 511: 400.000.000 đồng
- Nợ TK 3331: 40.000.000 đồng
- Có TK 131: 440.000.000 đồng
Bút toán hạch toán lại theo hóa đơn thay thế:
- Nợ TK 131: 440.000.000 đồng
- Có TK 511: 400.000.000 đồng
- Có TK 3331: 40.000.000 đồng
1.4. Hạch toán hóa đơn thay thế khi điều chỉnh giá bán
Doanh nghiệp E đã xuất hóa đơn với đơn giá 500 triệu đồng (chưa tính 10% thuế GTGT). Sau đó, phát hiện giá bán thực tế phải điều chỉnh tăng lên 550 triệu đồng, vì vậy cần phát hành hóa đơn thay thế.
Bút toán ban đầu:
- Nợ TK 131: 550.000.000 đồng
- Có TK 511: 500.000.000 đồng
- Có TK 3331: 50.000.000 đồng
Bút toán hủy hóa đơn gốc:
- Nợ TK 511: 500.000.000 đồng
- Nợ TK 3331: 50.000.000 đồng
- Có TK 131: 550.000.000 đồng
Bút toán ghi nhận lại theo giá mới:
- Nợ TK 131: 605.000.000 đồng
- Có TK 511: 550.000.000 đồng
- Có TK 3331: 55.000.000 đồng
Thuế GTGT được xác định lại theo giá bán điều chỉnh trên hóa đơn thay thế.
1.5. Hạch toán hóa đơn thay thế khi thay đổi thông tin khách hàng
Doanh nghiệp F đã xuất hóa đơn cho khách hàng M với giá trị 600 triệu đồng (chưa bao gồm 10% thuế GTGT). Tuy nhiên, sau đó phát sinh thay đổi về thông tin của khách hàng (ví dụ: mã số thuế), nên cần phát hành hóa đơn thay thế.
Bút toán ban đầu:
- Nợ TK 131: 660.000.000 đồng
- Có TK 511: 600.000.000 đồng
- Có TK 3331: 60.000.000 đồng
Bút toán hủy khi thay thế:
- Nợ TK 511: 600.000.000 đồng
- Nợ TK 3331: 60.000.000 đồng
- Có TK 131: 660.000.000 đồng
Bút toán ghi nhận lại theo thông tin khách hàng mới:
- Nợ TK 131: 660.000.000 đồng
- Có TK 511: 600.000.000 đồng
- Có TK 3331: 60.000.000 đồng
Xem thêm: Báo giá dịch vụ kế toán
2. Hạch toán hóa đơn thay thế có tác động đến báo cáo tài chính không?
Trong quá trình hoạt động, doanh nghiệp có thể phát sinh những trường hợp cần phải lập hóa đơn thay thế do sai sót, mất hóa đơn hoặc là thay đổi thông tin. Một vấn đề được nhiều kế toán quan tâm là: hạch toán hóa đơn thay thế có ảnh hưởng đến báo cáo tài chính không? Thực tế, việc ghi nhận lại bút toán từ hóa đơn thay thế không chỉ tác động đến doanh thu, chi phí mà còn ảnh hưởng trực tiếp đến lợi nhuận, thuế và các chỉ tiêu tài chính quan trọng của doanh nghiệp.

Việc hạch toán hóa đơn thay thế có thể tác động đến báo cáo tài chính, đặc biệt trong trường hợp hóa đơn gốc đã được phản ánh ở kỳ trước. Một số ảnh hưởng cụ thể gồm:
- Doanh thu/chi phí: Việc điều chỉnh làm thay đổi số liệu đã ghi nhận, từ đó ảnh hưởng đến lợi nhuận gộp và lợi nhuận sau thuế.
- Thuế GTGT: Khi phát hành hóa đơn thay thế, doanh nghiệp phải kê khai lại, có thể dẫn đến việc truy thu hoặc nộp bổ sung thuế.
- Công nợ và dòng tiền: Hóa đơn thay thế sẽ làm thay đổi số dư ở các tài khoản phải thu khách hàng hoặc phải trả nhà cung cấp, từ đó ảnh hưởng đến quản lý công nợ và dòng tiền.
- Báo cáo tài chính kỳ trước: Nếu hóa đơn thay thế liên quan đến các kỳ đã lập báo cáo, doanh nghiệp cần thực hiện điều chỉnh để đảm bảo tính chính xác và minh bạch.
- Chỉ số tài chính: Các chỉ tiêu quan trọng như tỷ suất lợi nhuận hay hệ số nợ trên vốn chủ sở hữu cũng có thể biến động do tác động từ hóa đơn thay thế.
Xem thêm: Hạch toán kế toán hành chính sự nghiệp là gì? hạch toán theo thông tư 107
Xem thêm: Hạch toán thu hộ chi hộ theo đúng quy định mới nhất 2026
3. Việc hạch toán HĐTT cho giao dịch nội bộ khác gì so với giao dịch bên ngoài?
Hạch toán hóa đơn thay thế trong giao dịch nội bộ về cơ bản tương tự như đối với giao dịch với bên ngoài, tuy nhiên có một số điểm khác biệt quan trọng cần lưu ý:
- Loại trừ khi hợp nhất: Các giao dịch nội bộ phải được loại bỏ trong báo cáo tài chính hợp nhất nhằm tránh tình trạng ghi nhận trùng doanh thu, chi phí hoặc tài sản.
- Đồng bộ ghi nhận: Khi phát hành hóa đơn thay thế, cả hai đơn vị tham gia giao dịch nội bộ cần hạch toán song song để đảm bảo số liệu trên sổ sách khớp nhau.
- Kiểm soát chặt chẽ: Cần có sự đối chiếu và kiểm tra kỹ lưỡng giữa các đơn vị để hạn chế rủi ro sai lệch.
- Tuân thủ quy định: Dù là giao dịch nội bộ, hóa đơn thay thế vẫn phải thực hiện đầy đủ nghĩa vụ thuế và kế toán theo quy định hiện hành, tương tự như với giao dịch bên ngoài.

4. Khi nào cần kê khai hóa đơn thay thế khác kỳ
Trong quá trình sử dụng hóa đơn điện tử, không ít doanh nghiệp gặp tình huống phải xuất hóa đơn thay thế – nhưng liệu bạn đã từng thắc mắc khi nào thì phải kê khai hóa đơn thay thế ở kỳ khác chưa?
Dựa trên Điều 19, khoản 2 của Nghị định 123/2020/NĐ-CP, khi phát hiện sai sót trong hóa đơn điện tử liên quan đến các chỉ tiêu quan trọng, người nộp thuế được chọn một trong hai phương án để xử lý: cấp hóa đơn điều chỉnh hoặc hóa đơn thay thế cho hóa đơn đã có sai sót.
Theo Điều 5 của Nghị định 209/2013/NĐ-CP và Điều 8 của Thông tư 219/2013/TT-BTC, thời điểm tính thuế giá trị gia tăng cho hàng hóa là khi quyền sở hữu hoặc quyền sử dụng hàng hóa được chuyển giao cho người mua, không phân biệt việc đã thu tiền hay chưa.
Đối với dịch vụ, thời điểm tính thuế là khi dịch vụ được cung ứng hoàn tất hoặc khi hóa đơn cung ứng dịch vụ được lập, không quan trọng việc đã thu tiền hay chưa.

Theo Khoản 1 của Điều 47 Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 và Khoản 4 của Điều 7 Nghị định 126/2020/NĐ-CP, người nộp thuế có thể bổ sung hồ sơ khai thuế ban đầu trong vòng 10 năm kể từ ngày kết thúc thời hạn nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế, trừ khi cơ quan thuế đã công bố quyết định thanh tra, kiểm tra.
Do đó, việc lập hóa đơn thay thế/điều chỉnh sẽ ảnh hưởng đến nghĩa vụ thuế giá trị gia tăng đã được khai báo trước đó. Vì vậy, cần phải nộp tờ khai thuế giá trị gia tăng bổ sung cho tháng/quý trong đơn vị đã có hóa đơn bị sai sót (không phải tờ khai bổ sung vào tháng có hóa đơn thay thế/điều chỉnh).
Khi hóa đơn thay thế/điều chỉnh và hóa đơn bị thay thế/bị điều chỉnh xảy ra ở hai kỳ khai thuế khác nhau (khác tháng/quý), doanh nghiệp phải khai báo hóa đơn thay thế/điều chỉnh trên tờ khai bổ sung của kỳ mà hóa đơn bị thay thế/bị điều chỉnh đã phát sinh.
5. Những trường hợp thực hiện thay thế hóa đơn
Không phải lúc nào sai sót trên hóa đơn cũng phải hủy – có một cách xử lý hiệu quả hơn: thay thế hóa đơn. Nhưng liệu bạn đã biết rõ những trường hợp nào được phép thực hiện thay thế hóa đơn theo đúng quy định?

Theo quy định tại Điều 19 Nghị định 123/2020/NĐ-CP, doanh nghiệp phải lập hóa đơn thay thế trong các tình huống sau đây.
1. Trường hợp người bán phát hiện hóa đơn điện tử đã được cấp mã của cơ quan thuế chưa gửi cho người mua có sai sót thì người bán thực hiện thông báo với cơ quan thuế theo Mẫu số 04/SS-HĐĐT Phụ lục IA ban hành kèm theo Nghị định này về việc hủy hóa đơn điện tử có mã đã lập có sai sót và lập hóa đơn điện tử mới, ký số gửi cơ quan thuế để cấp mã hóa đơn mới thay thế hóa đơn đã lập để gửi cho người mua. Cơ quan thuế thực hiện hủy hóa đơn điện tử đã được cấp mã có sai sót lưu trên hệ thống của cơ quan thuế.
2. Trường hợp hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế hoặc hóa đơn điện tử không có mã của cơ quan thuế đã gửi cho người mua mà người mua hoặc người bán phát hiện có sai sót thì xử lý như sau:
a) Trường hợp có sai sót về tên, địa chỉ của người mua nhưng không sai mã số thuế, các nội dung khác không sai sót thì người bán thông báo cho người mua về việc hóa đơn có sai sót và không phải lập lại hóa đơn. Người bán thực hiện thông báo với cơ quan thuế về hóa đơn điện tử có sai sót theo Mẫu số 04/SS-HĐĐT Phụ lục IA ban hành kèm theo Nghị định này, trừ trường hợp hóa đơn điện tử không có mã của cơ quan thuế có sai sót nêu trên chưa gửi dữ liệu hóa đơn cho cơ quan thuế.
b) Trường hợp có sai: mã số thuế; sai sót về số tiền ghi trên hóa đơn, sai về thuế suất, tiền thuế hoặc hàng hóa ghi trên hóa đơn không đúng quy cách, chất lượng thì có thể lựa chọn một trong hai cách sử dụng hóa đơn điện tử như sau:
b1) Người bán lập hóa đơn điện tử điều chỉnh hóa đơn đã lập có sai sót. Trường hợp người bán và người mua có thỏa thuận về việc lập văn bản thỏa thuận trước khi lập hóa đơn điều chỉnh cho hóa đơn đã lập có sai sót thì người bán và người mua lập văn bản thỏa thuận ghi rõ sai sót, sau đó người bán lập hóa đơn điện tử điều chỉnh hóa đơn đã lập có sai sót.
Hóa đơn điện tử điều chỉnh hóa đơn điện tử đã lập có sai sót phải có dòng chữ “Điều chỉnh cho hóa đơn Mẫu số… ký hiệu… số… ngày… tháng… năm”.
b2) Người bán lập hóa đơn điện tử mới thay thế cho hóa đơn điện tử có sai sót trừ trường hợp người bán và người mua có thỏa thuận về việc lập văn bản thỏa thuận trước khi lập hóa đơn thay thế cho hóa đơn đã lập có sai sót thì người bán và người mua lập văn bản thỏa thuận ghi rõ sai sót, sau đó người bán lập hóa đơn điện tử thay thế hóa đơn đã lập có sai sót.
Hóa đơn điện tử mới thay thế hóa đơn điện tử đã lập có sai sót phải có dòng chữ “Thay thế cho hóa đơn Mẫu số… ký hiệu… số… ngày… tháng… năm”.
Người bán ký số trên hóa đơn điện tử mới điều chỉnh hoặc thay thế cho hóa đơn điện tử đã lập có sai sót sau đó người bán gửi cho người mua (đối với trường hợp sử dụng hóa đơn điện tử không có mã của cơ quan thuế) hoặc gửi cơ quan thuế để cơ quan thuế cấp mã cho hóa đơn điện tử mới để gửi cho người mua (đối với trường hợp sử dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế).
c) Đối với ngành hàng không thì hóa đơn đổi, hoàn chứng từ vận chuyển hàng không được coi là hóa đơn điều chỉnh mà không cần có thông tin “Điều chỉnh tăng/giảm cho hóa đơn Mẫu số… ký hiệu… ngày… tháng… năm”. Doanh nghiệp vận chuyển hàng không được phép xuất hóa đơn của mình cho các trường hợp hoàn, đổi chứng từ vận chuyển do đại lý xuất.
Theo đó, doanh nghiệp phải lập hóa đơn thay thế trong những trường hợp sau đây:
- Trường hợp hóa đơn điện tử đã được cơ quan thuế cấp mã nhưng chưa gửi cho bên mua mà phát hiện có sai sót.
- Trường hợp hóa đơn điện tử, dù có hoặc không có mã của cơ quan thuế, đã được gửi cho người mua nhưng sau đó phát hiện có sai sót.
Ví dụ minh họa như sau:
- Ngày 25/06/2026, bên bán thực hiện lập và phát hành hóa đơn số 00001000.
- Đến ngày 10/07/2026, các bên phát hiện hóa đơn số 00001000 lập ngày 30/06/2026 có sai sót.
- Sau khi trao đổi và thống nhất, hai bên lựa chọn phương án xử lý bằng cách lập hóa đơn thay thế.
- Theo đó, bên bán đã phát hành hóa đơn thay thế số 00001095 vào ngày 5/07/2026.
- Sau khi hóa đơn thay thế được lập, trên phần mềm hóa đơn điện tử và trên Cổng thông tin hóa đơn điện tử của Tổng cục Thuế tại địa chỉ hoadondientu.gdt.gov.vn, hóa đơn số 00001000 được xác định là hóa đơn bị thay thế bởi hóa đơn số 00001095.
- Hóa đơn hợp lệ để sử dụng là hóa đơn thay thế số 00001095, còn hóa đơn số 00001000 không còn giá trị pháp lý.
6. Hướng dẫn kê khai hóa đơn thay thế khác kỳ
Hóa đơn thay thế cho kỳ kế toán nào phải được kê khai vào kỳ hiện tại khi hóa đơn thay thế được phát hành. Tuy nhiên, nếu hóa đơn thay thế liên quan đến một kỳ kế toán đã qua, bạn cần điều chỉnh vào kỳ hiện tại và ghi nhận trong báo cáo tài chính của kỳ đã phát hành hóa đơn thay thế.
| Sai sót | Chỉ tiêu tờ khai | Thủ tục |
| Sai sót này không ảnh hưởng đến số tiền thuế phải nộp hay số tiền thuế được khấu trừ. | Sai chỉ tiêu [23]: Giá trị hàng hóa mua vào [29], [30], [32], [32a]: Doanh thu từ hàng hóa và dịch vụ bán ra chịu thuế GTGT với các mức suất như sau: 0%, 5%, 10%, và không chịu thuế GTGT | Chỉ cần nộp Bản giải trình và các tài liệu liên quan, không cần phải nộp Tờ khai bổ sung. |
| Nếu việc khai bổ sung dẫn đến tăng số tiền thuế phải nộp hoặc giảm số tiền thuế đã được hoàn của kỳ gốc… | Sai sót này dẫn đến sự thay đổi trong chỉ tiêu [40] ‘KHBS’, tăng/giảm lên. | Nộp Tờ khai bổ sung và Bản giải trình trên tờ khai của kỳ nếu có sai sót như sau:
Đảm bảo nộp đủ số tiền thuế thiếu và các khoản chậm nộp. (Nếu chỉ tiêu [40] “KHBS” < 0: Theo dõi và bù trừ với số thuế phải nộp của các kỳ sau). |
| Nếu việc khai bổ sung chỉ dẫn đến thay đổi số tiền thuế giá trị gia tăng mà vẫn được khấu trừ trong các kỳ sau của kỳ gốc… | Sai sót chỉ làm tăng hoặc giảm chỉ tiêu [43] | Lập Tờ khai bổ sung và Bản giải trình trên tờ khai của kỳ nếu phát hiện sai sót như sau:
Ngoài ra trên tờ khai của kỳ, nếu phát hiện:
|
Lưu ý: Đảm bảo chỉ tiêu [22] của kỳ hiện tại phải khớp với chỉ tiêu [43] của tờ khai chính thức kỳ trước mà không cần điều chỉnh lũy kế từ các tờ khai khác.
Ví dụ 1: Hóa đơn bị thay thế và hóa đơn thay thế phát sinh trong cùng kỳ kê khai
Công ty Kế Toán Thiên Ưng thực hiện kê khai thuế GTGT theo quý.
- Ngày 20/07/2026, công ty phát sinh hoạt động bán hàng và lập hóa đơn số 00000920.
- Đến ngày 15/08/2026, công ty phát hiện hóa đơn số 00000920 lập ngày 20/07/2026 có sai sót và tiến hành lập hóa đơn thay thế số 00000935 cùng ngày.
Xét theo kỳ kê khai thuế của doanh nghiệp:
- Hóa đơn bị thay thế số 00000920 được lập ngày 20/07/2026, thuộc kỳ kê khai quý III năm 2026.
- Hóa đơn thay thế số 00000935 được lập ngày 15/08/2026, cũng thuộc kỳ kê khai quý III năm 2026.
Như vậy, trong trường hợp này, hóa đơn có sai sót và hóa đơn thay thế đều phát sinh trong cùng một kỳ kê khai thuế, cụ thể là quý III năm 2026.
Ví dụ 2: Hóa đơn bị thay thế và hóa đơn thay thế phát sinh ở hai kỳ kê khai khác nhau
Công ty Bảo Minh thực hiện kê khai thuế GTGT theo tháng.
- Ngày 25/06/2026, công ty bán hàng và lập hóa đơn số 00000800.
- Đến ngày 03/07/2026, phát hiện hóa đơn số 00000800 lập ngày 25/06/2026 có sai sót, công ty lập hóa đơn thay thế số 00000862 vào ngày 03/07/2026.
Căn cứ thời điểm lập hóa đơn và kỳ kê khai thuế:
- Hóa đơn bị thay thế số 00000800 được lập ngày 25/06/2026, thuộc kỳ kê khai tháng 6 năm 2026.
- Hóa đơn thay thế số 00000862 được lập ngày 03/07/2026, thuộc kỳ kê khai tháng 7 năm 2026.
Do đó, hóa đơn có sai sót và hóa đơn thay thế trong trường hợp này không cùng kỳ kê khai thuế.
Lưu ý:
Cách kê khai đối với hóa đơn thay thế phát sinh cùng kỳ và khác kỳ là không giống nhau. Vì vậy, trước khi thực hiện kê khai hóa đơn thay thế, người làm kế toán cần xác định rõ hóa đơn thuộc cùng kỳ hay khác kỳ để thực hiện kê khai đúng quy định pháp luật về thuế.
Tóm lại, hạch toán hóa đơn thay thế đòi hỏi sự chính xác và tuân thủ đúng quy định nhằm hạn chế tối đa rủi ro cho doanh nghiệp. Thực hiện chuẩn ngay từ đầu không chỉ giúp kế toán dễ dàng hơn mà còn nâng cao tính minh bạch của sổ sách. Nếu cần tư vấn hoặc hỗ trợ về dịch vụ kế toán thuế, đừng ngần ngại mà hãy gọi ngay cho AZTAX qua số HOTLINE: 0932.383.089 để tư vấn và hỗ trợ kịp thời.
Xem thêm: Hướng dẫn hạch toán ngoại tệ theo thông tư 200
Xem thêm: Hướng dẫn hạch toán sáp nhập doanh nghiệp
Xem thêm:Nhóm tài khoản chi phí: Khái niệm và phân loại chi tiết nhất











