Chi nhánh có phải nộp thuế môn bài không?

Chi nhánh có phải nộp thuế môn bài không là thắc mắc phổ biến của nhiều doanh nghiệp khi mở rộng hoạt động kinh doanh. Việc xác định đúng nghĩa vụ thuế giúp doanh nghiệp tránh bị xử phạt và tuân thủ đúng quy định pháp luật. Trong bài viết này, AZTAX sẽ giải đáp chi tiết về điều kiện, mức thu và cách kê khai thuế môn bài cho chi nhánh. Cùng tìm hiểu ngay!

1. Thuế môn bài là gì?

Thuế môn bài (hay còn gọi là lệ phí môn bài) là một loại thuế trực thu, được áp dụng hàng năm đối với các tổ chức, cá nhân hoạt động sản xuất – kinh doanh hàng hóa, dịch vụ.

Đối với doanh nghiệp tại Việt Nam, lệ phí môn bài được ấn định theo mức vốn điều lệ ghi trong Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp hoặc theo doanh thu (áp dụng cho hộ, cá nhân kinh doanh). Đây là khoản thu bắt buộc và không phụ thuộc vào kết quả kinh doanh lãi hay lỗ.

Tại mỗi quốc gia hoặc từng địa phương, cách xác định mức thuế môn bài có thể khác nhau:

• Dựa trên số vốn đăng ký
• Dựa vào doanh thu năm trước
• Hoặc căn cứ theo giá trị gia tăng trong năm tài chính trước liền kề.

Tại Việt Nam, hiện nay thuế môn bài được quy định cụ thể tại Nghị định 139/2016/NĐ-CP, được sửa đổi, bổ sung bởi Nghị định 22/2020/NĐ-CP và hướng dẫn tại Thông tư 80/2021/TT-BTC.

2. Những đối tượng phải nộp lệ phí môn bài

Theo quy định tại Điều 2 Nghị định số 139/2016/NĐ-CP, đối tượng nộp lệ phí môn bài bao gồm tổ chức, cá nhân và hộ gia đình có hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ trên lãnh thổ Việt Nam.

Trong đó, chi nhánh, văn phòng đại diện và địa điểm kinh doanh của các tổ chức nêu trên cũng được xác định là đối tượng phải kê khai và nộp lệ phí môn bài nếu có hoạt động sản xuất – kinh doanh.

Cụ thể, các tổ chức có chi nhánh thuộc diện nộp lệ phí môn bài bao gồm:

• Doanh nghiệp được thành lập theo pháp luật Việt Nam
• Tổ chức thành lập theo Luật Hợp tác xã
• Các đơn vị sự nghiệp công lập và ngoài công lập
• Tổ chức kinh tế của tổ chức chính trị, tổ chức chính trị – xã hội, tổ chức xã hội – nghề nghiệp
• Các tổ chức khác có hoạt động kinh doanh theo quy định pháp luật.

3. Chi nhánh có phải nộp thuế môn bài không?

Câu trả lời là có. Theo quy định tại khoản 6 Điều 2 Nghị định 139/2016/NĐ-CP, các chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh của tổ chức (nêu tại các khoản 1 đến 5 của điều này) đều thuộc diện phải nộp lệ phí môn bài nếu có hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ.

Cụ thể, chi nhánh của các tổ chức sau đây sẽ phải thực hiện nghĩa vụ nộp lệ phí môn bài:

• Doanh nghiệp được thành lập và hoạt động theo quy định pháp luật Việt Nam;
• Hợp tác xã, liên hiệp hợp tác xã được thành lập theo Luật Hợp tác xã;
• Đơn vị sự nghiệp công lập hoặc ngoài công lập theo quy định của pháp luật;
• Các tổ chức kinh tế thuộc tổ chức chính trị, tổ chức chính trị – xã hội, tổ chức xã hội, tổ chức xã hội – nghề nghiệp, lực lượng vũ trang nhân dân;
• Các tổ chức khác có hoạt động sản xuất, kinh doanh.

Như vậy, nếu doanh nghiệp có thành lập chi nhánh và chi nhánh này có hoạt động kinh doanh thì sẽ phải kê khai và nộp lệ phí môn bài theo đúng quy định pháp luật hiện hành.

4. Chi nhánh mới thành lập có được miễn thuế môn bài không?

Chi nhánh của doanh nghiệp mới thành lập sẽ được miễn lệ phí môn bài trong năm đầu tiên kể từ khi được cấp mã số thuế.

Căn cứ theo quy định tại khoản 8 Điều 3 Nghị định 139/2016/NĐ-CP, đã được sửa đổi, bổ sung bởi điểm c khoản 1 Điều 1 Nghị định 22/2020/NĐ-CP, các trường hợp sau sẽ được miễn lệ phí môn bài trong năm đầu hoạt động (tính từ ngày 01/01 đến 31/12):

• Doanh nghiệp, tổ chức vừa được thành lập và được cấp mã số thuế/mã số doanh nghiệp mới;

• Hộ kinh doanh, cá nhân hoặc nhóm cá nhân bắt đầu hoạt động sản xuất – kinh doanh lần đầu;

• Trong thời gian các đối tượng trên đang được miễn, nếu phát sinh thêm chi nhánh, văn phòng đại diện hoặc địa điểm kinh doanh thì các đơn vị phụ thuộc này cũng được hưởng miễn lệ phí môn bài tương ứng trong cùng thời gian.

Tóm lại, chi nhánh chỉ được miễn lệ phí môn bài nếu được thành lập trong năm đầu tiên của doanh nghiệp mẹ và cùng thời gian hưởng chính sách miễn giảm.

5. Hướng dẫn nộp lệ phí môn bài cho chi nhánh

Hiện nay, doanh nghiệp có thể thực hiện việc nộp tờ khai lệ phí môn bài cho chi nhánh thông qua 03 phương thức như sau:

5.1 Nộp trực tiếp tại cơ quan thuế

• Doanh nghiệp cần tải mẫu tờ khai lệ phí môn bài (01/MBAI) về máy.
• Sau khi điền đầy đủ thông tin theo yêu cầu, người đại diện pháp luật ký tên, đóng dấu rồi mang hồ sơ đến Chi cục Thuế quản lý trực tiếp chi nhánh để nộp.
• Lưu ý: Trước khi đến nộp, nên liên hệ với cơ quan thuế để xác nhận việc còn tiếp nhận hồ sơ giấy hay không, vì phần lớn hiện nay các chi cục thuế đã chuyển sang nhận tờ khai qua mạng.

5.2 Nộp qua phần mềm HTKK và Cổng thông tin thuế điện tử

Bước 1: Đăng nhập vào phần mềm HTKK

• Vào mục: Phí – Lệ phí ⇨ Chọn Tờ khai lệ phí môn bài (01/MBAI)
• Chọn kỳ tính thuế là “Tờ khai lần đầu” hoặc “Cơ sở mới thành lập” tùy từng trường hợp.

Bước 2: Nhập đầy đủ thông tin của chi nhánh:

• Mã số thuế, tên chi nhánh, mức lệ phí môn bài phải nộp.
• Nếu chi nhánh cùng tỉnh với trụ sở chính, sử dụng MST chính có thêm đuôi -QL.

Bước 3: Kết xuất tờ khai

• Chọn “Kết xuất XML” để lưu file.

Bước 4: Nộp tờ khai

• Truy cập https://thuedientu.gdt.gov.vn
• Đăng nhập và tải file XML đã kết xuất lên hệ thống để nộp.

5.3 Nộp trực tuyến trên Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế

Bước 1: Truy cập website thuedientu.gdt.gov.vn

• Đăng nhập bằng chữ ký số của doanh nghiệp (hoặc của chi nhánh nếu khác tỉnh).

Bước 2: Vào mục “Khai thuế” ⇨ Chọn “Kê khai trực tuyến” ⇨ Chọn “Tờ khai lệ phí môn bài (LPMB – theo Thông tư 80/2021)”.

Bước 3:

• Chi nhánh cùng tỉnh: hệ thống tự nhận cơ quan thuế quản lý, chọn loại tờ khai là “chính thức” (lần đầu), nhập đầy đủ thông tin và tích chọn mục “Địa điểm kinh doanh mới thành lập trong năm”. Hệ thống sẽ tự động xác định mức lệ phí.
• Chi nhánh khác tỉnh: chọn mức lệ phí tương ứng, điền thông tin người nộp hoặc đại diện pháp luật.

Bước 4: Nhấn “Hoàn thành kê khai” ⇨ Ký số ⇨ Gửi tờ khai.

Phương thức nộp lệ phí môn bài sau khi kê khai:

Sau khi hoàn tất tờ khai, doanh nghiệp có thể chọn một trong hai hình thức nộp lệ phí sau:

• • Nộp tiền mặt tại Kho bạc Nhà nước thông qua ngân hàng (thường là VietinBank) tại quận/huyện nơi chi nhánh đặt trụ sở.

• Nộp thuế điện tử qua hệ thống ngân hàng liên kết với Tổng cục Thuế (cần có chữ ký số và tài khoản ngân hàng đăng ký).

6. Mã chương nộp thuế môn bài được quy định như thế nào?

Trong hệ thống mục lục ngân sách nhà nước, “Chương” là yếu tố dùng để xác định cơ quan được giao nhiệm vụ thu, chi ngân sách. Mỗi chương sẽ tương ứng với một mã số gồm 3 chữ số, được sắp xếp theo cấp bậc quản lý của cơ quan chủ quản như sau:

Hiểu đơn giản, mã chương nộp thuế môn bài là mã định danh phản ánh cơ quan thuế trực tiếp quản lý doanh nghiệp hoặc tổ chức kinh tế. Việc xác định đúng mã chương là yếu tố bắt buộc khi kê khai lệ phí môn bài để đảm bảo nộp đúng nơi, đúng quy định.

Căn cứ theo Phụ lục I Thông tư 324/2016/TT-BTC, danh mục mã chương nộp thuế môn bài năm 2025 được chia theo từng nhóm đối tượng và cấp quản lý như sau:

Mã chương thuộc cấp Trung ương:

• : Doanh nghiệp 100% vốn đầu tư nước ngoài tại Việt Nam
• : Đơn vị có vốn nước ngoài từ 51% đến dưới 100% hoặc công ty hợp danh có thành viên người nước ngoài
• : Doanh nghiệp Việt Nam đầu tư ra nước ngoài
• : Doanh nghiệp ngoài quốc doanh (hỗn hợp)
• : Doanh nghiệp hỗn hợp có vốn nhà nước >50%
• : Đơn vị có vốn nhà nước ≤50%
• : Quan hệ ngân sách khác
• : Nhà thầu chính/phụ nước ngoài

Mã chương thuộc cấp Tỉnh:

• 551 – 564: Gồm các doanh nghiệp FDI, hợp tác xã, hộ kinh doanh cá thể, nhà thầu nước ngoài, các đơn vị có vốn nhà nước, tổng công ty địa phương…

Mã chương thuộc cấp Huyện:

• 754 – 759: Thường áp dụng cho các doanh nghiệp ngoài quốc doanh, doanh nghiệp tư nhân, hợp tác xã, hộ cá thể và đơn vị kinh tế hỗn hợp thuộc phạm vi quản lý của Chi cục Thuế cấp huyện.

Trong thực tế, đa số doanh nghiệp tại Việt Nam sẽ thuộc sự quản lý trực tiếp của Chi cục Thuế cấp huyện, do đó mã chương lệ phí môn bài thường nằm trong khoảng 754 đến 759, tùy thuộc vào loại hình doanh nghiệp và tỷ lệ sở hữu vốn nhà nước (nếu có).

7. Mức thuế môn bài bậc 2 hiện nay là bao nhiêu?

Theo quy định tại Mục 2850 Phụ lục III Thông tư 324/2016/TT-BTC (được sửa đổi, bổ sung bởi Thông tư 93/2019/TT-BTC), tiểu mục 2863 được dùng để thu lệ phí môn bài mức (bậc) 2, là mức thu đứng thứ hai trong hệ thống phân bậc thuế môn bài.

Căn cứ theo Điều 4 Nghị định 139/2016/NĐ-CP, được sửa đổi bởi Nghị định 22/2020/NĐ-CP, mức lệ phí môn bài bậc 2 năm 2025 được quy định như sau:

Đối với tổ chức:

• Doanh nghiệp có vốn điều lệ hoặc vốn đầu tư từ 10 tỷ đồng trở xuống sẽ phải nộp 2.000.000 đồng/năm.

Đối với cá nhân, hộ kinh doanh:

• Hộ kinh doanh, nhóm cá nhân, hoặc cá nhân có doanh thu từ trên 300 triệu đến 500 triệu đồng/năm sẽ áp dụng mức lệ phí môn bài bậc 2 là 500.000 đồng/năm.

Lưu ý: Mức thu lệ phí môn bài bậc 2 được xác định căn cứ vào:

• Đối với tổ chức: Dựa trên vốn điều lệ hoặc vốn đầu tư ghi trong Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp hoặc đăng ký đầu tư.
• Đối với hộ/cá nhân kinh doanh: Dựa trên doanh thu thực tế trong năm, theo hướng dẫn của Bộ Tài chính.

Chi nhánh có phải nộp thuế môn bài không là thắc mắc phổ biến của nhiều doanh nghiệp khi mở rộng hoạt động kinh doanh. Việc xác định đúng nghĩa vụ kê khai và nộp lệ phí môn bài cho chi nhánh là điều cần thiết để tránh vi phạm và bị xử phạt hành chính. Nếu bạn vẫn còn băn khoăn hoặc muốn được hướng dẫn chi tiết theo tình huống thực tế của đơn vị mình, hãy liên hệ ngay với AZTAX qua Hotline: 0932 383 089 để được tư vấn miễn phí và hỗ trợ nhanh chóng từ đội ngũ chuyên gia giàu kinh nghiệm!